此次,四方共同合作的“云之稻項目“,源自比爾梅琳達蓋茨基金“為非洲和亞洲資源貧瘠地區(qū)培育綠色超級稻”和國家國際合作專項資助的3000份水稻基因組項目的成果。根據(jù)協(xié)議,基于3000份水稻基因組測序數(shù)據(jù)和種質資源的“云之稻項目”將無償共享,同時項目組還將建立水稻最全面的“水稻功能基因組和育種信息數(shù)據(jù)庫”,為基礎研究和育種應用提供可供參考的重要信息。
綠色超級稻項目首席科學家、中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所黎志康博士介紹說,該項目簡稱為綠色超級稻項目,由中國農(nóng)業(yè)科學院牽頭組織實施,項目總體目標是培育能夠廣泛適用于灌溉和雨養(yǎng)地區(qū)生態(tài)環(huán)境,并具有氮磷高效利用、抗病、抗蟲、高產(chǎn)、優(yōu)質、抗逆(干旱、鹽堿)等特性的水稻新品種,在目標國家進行示范和推廣,推動雜交稻種子的生產(chǎn)能力,并為撒哈拉以南非洲國家、亞洲和中國的西南地區(qū)水稻分子育種建立一個高效水稻基因型分析技術平臺。
據(jù)透露,3000份水稻核心種質基因組測序項目是迄今為止全世界最大的植物基因組測序項目。這項研究將加快規(guī)?;l(fā)掘水稻優(yōu)良基因,突破水稻復雜性狀分子改良的技術瓶頸,加快高產(chǎn)、優(yōu)質、廣適性新品種培育的進程,全面提升我國及全球水稻基因組研究和分子育種水平。
在回答記者提問時,黎志康博士表示,“對3000份水稻核心種質基因組測序分析,能夠回答‘水稻有多少的遺傳多樣性可以應用,從哪里獲取所生物育種需要的遺傳資源’的問題,分析得到的數(shù)據(jù)將為水稻的基礎認識和生物育種提供基礎信息資源。這項研究將揭示全球栽培稻資源的基因組多樣性,和每個水稻資源的遺傳特點和其應用價值。”
他進一步補充說,這項研究將3000份水稻種質資源帶入水稻育種應用中,將為水稻育種創(chuàng)新提供材料和新思路。3000份水稻核心種質重測序項目的分析結果還將填補人們對水稻甚至各個物種在基因組學方面的一些知識空缺。后基因組時代結合功能基因組學新的方法和策略進行生物育種,將貢獻于糧食安全,食品健康的發(fā)展。
黎志康告訴記者,3000份水稻基因組測序項目分析得到的數(shù)據(jù)量達到幾百T,生物學研究進入了大數(shù)據(jù)時代,需要全世界所有科學家和有興趣的人士參與進來分析挖掘,阿里云將提供一個很好的平臺,同時阿里云平臺結合眾多的科學研究人員也會促進生物大數(shù)據(jù)行業(yè)的快速發(fā)展。
業(yè)內專家指出,當基因研究進入大數(shù)據(jù)時代,傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)共享模式和分析工具已經(jīng)遭遇到瓶頸,成為阻礙行業(yè)發(fā)展的一大痛點。
阿里云高級專家林河山表示,"水稻基因數(shù)據(jù)公益云平臺構建在阿里云的對象存儲服務和批量計算服務之上。阿里云的對象存儲服務(簡稱OSS)是阿里云自主研發(fā)的分布式存儲系統(tǒng),具備海量的存儲空間和幾乎無限的擴容能力,并且通過多重數(shù)據(jù)冗余備份和自動的故障恢復機制保證數(shù)據(jù)安全。通過OSS提供的免費存儲和下載服務,Rice 3K項目的水稻基因組數(shù)據(jù)可以隨時為全球科學家所用。“
他還表示,“阿里云批量計算服務為數(shù)據(jù)的分析和解讀提供了海量的計算資源。批量計算服務是專門針對基因數(shù)據(jù)分析等計算密集型應用設計的分布式云服務,其自動的資源管理、靈活的任務調度和工作流支持大大簡化了在云上搭建水稻基因分析平臺的過程。"
阿里云方面表示,阿里云希望未來可以和更多的公共基因組項目合作,通過阿里云大數(shù)據(jù)相關服務與業(yè)界專家領域知識的緊密結合,共同推動基因測序行業(yè)的變革。目前,阿里云已經(jīng)與貝瑞和康、中科院計算研究所等國內領先的基因公司以及研究機構展開合作。