Geneformics D基于Geneformics與以色列魏茨曼研究所共同研發(fā)的無損壓縮技術,可為基因組云端程序提供企業(yè)級的基礎設施服務(IaaS)。運用Geneformics D技術,從人群測序、基因庫、遺傳、罕見疾病、癌癥和基因組學藥物治療研究中提取的精準醫(yī)學數據可被自動壓縮,這一過程對用戶透明,從而高效地節(jié)省時間,帶寬及大量存儲空間。
Geneformics CEO Rafael Feitelber 表示:“精準醫(yī)學正在促使醫(yī)療及研究機構將基因組數據分析過程從本地向云端架構遷移, 因為云端架構的高可擴展性,共享性和易用性更具有吸引力。現在,通過Geneformics D技術,相關機構可以通過云端高可擴展的無縫基因組數據壓縮大大加快數據分析流程,減少儲存需求。
Geneformics公司的創(chuàng)始人兼CTO Arik Keshet表示:“單個人類全基因組測序的數據量大約為250-300GB,Geneformics目前致力解決海量數據給第二代測序從業(yè)人員所帶來的巨大挑戰(zhàn)。通過使用Geneformics D技術,經壓縮的全基因組數據大小僅有原來的十分之一。同時,由于Geneformics D技術與底層架構的無縫整合,使得用戶不需要改變任何的數據格式和應用接口。
Geneformics D采用分布式的、云端壓縮文件系統(tǒng),目前已整合至亞馬遜網絡服務(AWS),Geneformics D未來版本將會陸續(xù)整合其他云服務提供商。Geneformics D軟件安裝在每個計算實例上,協(xié)同實現一個對象即文件(object-as-file),經過透明壓縮的Linux標準文件系統(tǒng)。Geneformics D動態(tài)解壓縮技術讓采用原生FASTQ和BAM格式的數據分析應用不需修改即可使用,從而保證對生物信息流程的影響最小。
其他Geneformics D功能包括: