中科院作為國家在科學(xué)技術(shù)方面的最高學(xué)術(shù)機構(gòu)和全國自然科學(xué)與高新技術(shù)的綜合研究與發(fā)展中心,近年來為國家文明的發(fā)展做出了重要貢獻。此次中科院計算所高性能計算中心的生命科學(xué)研究項目,正是為了進一步推動國家對于生命科學(xué)研究的認知與理解。面對龐大的研究對象和復(fù)雜的基因內(nèi)在聯(lián)系,高性能計算在生命科學(xué)的研究和發(fā)展中起到了重要的作用。
    
近年來,由于測序技術(shù)的飛速發(fā)展,人類發(fā)現(xiàn)的基因序列數(shù)目按照指數(shù)級增長。面對數(shù)量龐大的基因進行同源性搜尋,比對,分析,遺傳發(fā)育分析等等,巨大的數(shù)據(jù)處理量和并行計算量則也是如影隨形。同時,由于生命科學(xué)的研究對象往往是蛋白質(zhì)和DNA的大分子,對這些分子的三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測,動力學(xué)特性、熱力學(xué)特性、在生命過程中如何發(fā)生作用,而這些科學(xué)問題更是要借助于高性能計算機。所以高性能計算機在生命科學(xué)研究中,應(yīng)用非常廣泛,扮演著極其重要的角色。
    
曙光有著龐大應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)以及豐富產(chǎn)品線的高端科技廠商,其所研發(fā)的系列服務(wù)器產(chǎn)品在國內(nèi)受到了各行各業(yè)的普遍認可。曙光的高性能計算技術(shù)在不斷的應(yīng)用中喚起了更多國內(nèi)用戶對于高性能計算技術(shù)的認知,為中國高性能計算的發(fā)展壯大與普及奠定了重要的基礎(chǔ)。
    
據(jù)了解,此次的核心應(yīng)用服務(wù)器產(chǎn)品是曙光TC3600刀片服務(wù)器系統(tǒng),該系統(tǒng)不僅是全球首款符合SSI標(biāo)準(zhǔn)可實現(xiàn)全面兼容的刀片服務(wù)器系統(tǒng),還是標(biāo)志了中國高性能計算最高成就的星云系統(tǒng)的核心部件。
    
業(yè)界人士介紹,曙光TC3600不僅擁有強大靈活的網(wǎng)絡(luò)和I/O擴展能力、強大的計算能力、綠色節(jié)能、高效智能的電源策略和散熱策略等眾多高效性優(yōu)勢,還融入了諸多先進的設(shè)計理念和技術(shù)特性,是業(yè)界當(dāng)之無愧的最新一代刀片服務(wù)器產(chǎn)品。
    
曙光TC3600總共擁有10個計算刀片,并且擁有曙光自行研發(fā)的彈性存儲模塊,最大單刀片可以使用12塊2.5寸硬盤,并且擁有4個大功率冗余電源,支持N+1和N+N等方式冗余。同時,該刀片系統(tǒng)為每個計算單元配備了兩顆四核Intel Xeon處理器,擁有96GB的內(nèi)存,可支持符合SSI標(biāo)準(zhǔn)的高速模塊、低速模塊、IB子卡和管理模塊。
    
在系統(tǒng)的關(guān)鍵部件和功能模塊,TC3600還采用了冗余設(shè)計,可實現(xiàn)企業(yè)級的RAS特性,滿足關(guān)鍵應(yīng)用的需求。其所具備的良好的系統(tǒng)可伸縮性,可根據(jù)需求實現(xiàn)靈活的按需配置。通過IO Blade實現(xiàn)IO擴展,可為計算刀片提供更多的磁盤和標(biāo)準(zhǔn)PCI-E接口;系統(tǒng)可支持40Gb的Infiniband QDR網(wǎng)絡(luò),10Gb 以太網(wǎng)絡(luò)和1Gb以太網(wǎng)絡(luò),4Gb/8Gb FC網(wǎng)絡(luò);同時配置存儲模塊,可實現(xiàn)10塊磁盤的擴展,并靈活分配給各個計算刀片。
    
作為全球第一款符合SSI的開放性標(biāo)準(zhǔn)的刀片服務(wù)器系統(tǒng),TC3600刀片服務(wù)器不僅以開放性標(biāo)準(zhǔn)打破了壟斷和“孤島”,為形成產(chǎn)業(yè)鏈提供了前提條件,而且為用戶獲得更多的產(chǎn)品選擇和完善服務(wù),降低TCO等提供了保障。 TC3600刀片服務(wù)器不僅能夠?qū)崿F(xiàn)高性能、高密度、可伸縮、按需配置、方案靈活的產(chǎn)品設(shè)計,而且可滿足用戶多樣且動態(tài)變化的應(yīng)用需求。其具有企業(yè)級產(chǎn)品的RAS特性,可完全滿足政府、電信、金融、教育、互聯(lián)網(wǎng)等關(guān)鍵用戶的需要。
    
曙光TC3600入駐中科院計算所高性能計算中心生命科學(xué)研究項目,可有效提升計算中心系統(tǒng)的計算能力、高性能、高可靠性以及綠色節(jié)能等。將為降低系統(tǒng)功耗,提高系統(tǒng)電源效率和制冷效率提供重要支持。
    
此次應(yīng)用于生命科學(xué)研究項目,必將為項目的順利展開以及開拓更加龐大的計算能力起到重要的作用。其靈活擴展能力、強大計算能力、高性能、高可靠性以及綠色節(jié)能產(chǎn)品等特性,也將進一步助力中科院計算所高性能計算中心實現(xiàn)系統(tǒng)提升和節(jié)能低碳的目標(biāo)。
   

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