并行計(jì)算群的網(wǎng)絡(luò)互連結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)存儲(chǔ)是影響生物信息學(xué)和計(jì)算生物學(xué)程序性能的重要因素。通常的服務(wù)器機(jī)群采用1000Mb 或10000Mb 以太網(wǎng)互連，只能滿足一般速度要求和任務(wù)并行程序的要求。而浪潮刀片系統(tǒng)則在所有節(jié)點(diǎn)之間都采用了56Gbps的InfiniBand高速互連網(wǎng)絡(luò)，可以和傳統(tǒng)的MPP（大規(guī)模并行處理）計(jì)算機(jī)媲美，可同時(shí)滿足高通量計(jì)算和高性能并行計(jì)算應(yīng)用的需要。這使得該超級(jí)計(jì)算機(jī)擁有較高的浮點(diǎn)運(yùn)算性能，是目前蘇州地區(qū)高校性能最高的超算系統(tǒng)。

為便于管理和訪問生物序列數(shù)據(jù)庫(kù)，浪潮還將所有計(jì)算節(jié)點(diǎn)都通過(guò)TSExaStor并行文件系統(tǒng)共享磁盤，并通過(guò)高速磁盤陣列確保了高性能計(jì)算對(duì)于硬盤速度和容量的需求。TSExaStor是浪潮依托“高效能服務(wù)器和存儲(chǔ)技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)試驗(yàn)室”，為滿足高性能科學(xué)計(jì)算領(lǐng)域?qū)Υ鎯?chǔ)的苛刻要求，自主研發(fā)的高帶寬、高IOPS的統(tǒng)一存儲(chǔ)系統(tǒng)，完全滿足了Gaussian MP2等計(jì)算方法較高IO帶寬要求，也讓整個(gè)系統(tǒng)數(shù)以千計(jì)的客戶端、服務(wù)器和存儲(chǔ)設(shè)備之間實(shí)現(xiàn)了完全并行。同時(shí)，元數(shù)據(jù)服務(wù)器和對(duì)象數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在不同的設(shè)備，兩個(gè)對(duì)象存儲(chǔ)服務(wù)器采用Actice-Active方式運(yùn)行。采用多控制器體系架構(gòu)，具有高度安全性的特性；支持PB級(jí)容量擴(kuò)展，全局統(tǒng)一命名空間，性能隨容量的增加而線性提升。浪潮還為并行存儲(chǔ)系統(tǒng)配備了自主開發(fā)的智能化、專用定制化的存儲(chǔ)管理界面，支持圖形化界面顯示，支持圖形化安裝與部署，定制化的備份策略，可選擇備份到其它文件系統(tǒng)，可實(shí)現(xiàn)存儲(chǔ)資源的量化和用戶配額制。

同時(shí)，集群系統(tǒng)采用浪潮自主開發(fā)的智能化、專用定制化的ClusterEngine超算云服務(wù)平臺(tái)，ClusterEngine是專為浪潮天梭系列HPC集群定制的一款軟件，該軟件采用B/S架構(gòu)，通過(guò)瀏覽器（IE、Firefox等）進(jìn)行操作，是一套全面實(shí)現(xiàn)了集群的監(jiān)控、管理、資源調(diào)度、報(bào)警的軟件，具有更多人性化功能，可以更快的構(gòu)建系統(tǒng)、完善應(yīng)用系統(tǒng)、強(qiáng)化管理系統(tǒng)，提升整體集群的使用效果，提升應(yīng)用效率。

除了上述之外，浪潮還提供了獨(dú)具特色的應(yīng)用特征分析軟件天眼及行業(yè)領(lǐng)先的應(yīng)用調(diào)優(yōu)服務(wù)體系，幫助蘇大放射醫(yī)學(xué)院解決應(yīng)用瓶頸和計(jì)算程序算法二次開發(fā)熱點(diǎn)分析服務(wù)。

蘇大放射醫(yī)學(xué)院高性能計(jì)算平臺(tái)負(fù)責(zé)人表示，“浪潮在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的專業(yè)應(yīng)用調(diào)優(yōu)服務(wù)和豐富的異構(gòu)架構(gòu)的應(yīng)用移植經(jīng)驗(yàn)是我們選擇浪潮的原因所在?！彼麑?duì)浪潮天眼印象深刻，認(rèn)為它在計(jì)算、IO、網(wǎng)絡(luò)、內(nèi)存四個(gè)維度的基礎(chǔ)上細(xì)化出包括實(shí)時(shí)內(nèi)存讀取帶寬在內(nèi)的40余項(xiàng)應(yīng)用特征指標(biāo)，實(shí)現(xiàn)了對(duì)軟件應(yīng)用的特征更為精確的量化刻畫和分析，能夠方便地察看任務(wù)負(fù)載、CPU利用率、網(wǎng)絡(luò)、內(nèi)存、存儲(chǔ)的使用情況以及當(dāng)前系統(tǒng)整體運(yùn)行狀態(tài)或單個(gè)節(jié)點(diǎn)的運(yùn)行狀態(tài)。而且當(dāng)對(duì)天眼工具分析的結(jié)果疑惑時(shí)，浪潮應(yīng)用團(tuán)隊(duì)可以提供專業(yè)的分析和定位服務(wù)，“這種專業(yè)增值服務(wù)很好的解決了我們的后顧之憂，讓整個(gè)研究團(tuán)隊(duì)可以專注于科學(xué)研究之中?！?/p>

xiesc