鑒于計算化學應(yīng)用需要強大的浮點運算能力,并對計算節(jié)點有著大內(nèi)存、低功耗和協(xié)作程度高的要求,根據(jù)客戶的應(yīng)用特點和前期測試結(jié)果,浪潮將計算模塊分為三類,即普通計算節(jié)點、厚節(jié)點和胖節(jié)點,分層次解決不同任務(wù)的計算需求。
其中,普通節(jié)點采用了110臺NX7100DB刀片。考慮到計算化學軟件計算過程中常會產(chǎn)生許多大容量的臨時文件,這款7U10刀的高性能刀片專門配置了500GB的3.5寸SATA硬盤,在存儲容量和速度上優(yōu)勢明顯;用10臺刀片組成的厚節(jié)點主要是來處理對運算速度有苛刻要求的大型計算任務(wù),專門配置高主頻高性能的處理器,配合每節(jié)點32GB內(nèi)存和Raid 5,使計算性能、I/O速度、數(shù)據(jù)安全都有了可靠保證;而對于一些對內(nèi)存容量要求很高的計算任務(wù),則用2臺四路六核NF560D2來承擔,采用英特爾® 至強® 7460 處理器,高達96GB的內(nèi)存容量,加上8TB的本地存儲容量和1+1+1全熱備冗余電源,能夠妥善解決計算化學軟件帶來的計算壓力。
這套浪潮TS10000共包括128個節(jié)點,1套20TB存儲盤陣,采用20Gbps全線速Infiniband網(wǎng)絡(luò)與計算節(jié)點實現(xiàn)高速互聯(lián),具有計算性能優(yōu)越、功耗控制領(lǐng)先、監(jiān)控管理系統(tǒng)方便易用、系統(tǒng)開放易于擴展、服務(wù)體系完善等特點。
經(jīng)過浪潮高性能工程師的方案調(diào)優(yōu),系統(tǒng)的計算能力峰值為10.98萬億次每秒,Linpack測試效率為0.806,進入09年國內(nèi)高性能計算TOP100排名,是國內(nèi)計算化學領(lǐng)域單臺計算性能最強的高性能計算機。
科研起飛的開端,廠商實力的映證
浪潮天梭TS10000系統(tǒng)的上線,使山西師范大學的計算化學研究獲得了起飛的平臺。以前需要幾個星期甚至一兩個月進行計算的任務(wù),現(xiàn)在縮短到了幾天時間。往常計算任務(wù)"塞車",科研進度受拖累的現(xiàn)象隨之消除??蒲行实拇笞冞w正在推動山西師范大學的化學、材料科學研究向全國前十的目標邁進。
而對于浪潮而言,贏得此次項目,靠的不僅是浪潮優(yōu)異的產(chǎn)品、良好的服務(wù),更是靠浪潮在科學計算領(lǐng)域豐富的應(yīng)用經(jīng)驗、業(yè)界領(lǐng)先的方案解決和本地化服務(wù)能力。
經(jīng)過多年實踐,浪潮的高性能團隊擁有了大批專業(yè)的HPC應(yīng)用工程師、系統(tǒng)工程師。他們不僅在計算節(jié)點構(gòu)建、高速網(wǎng)絡(luò)交換方面積累了深厚的技術(shù)功底,還在HPC應(yīng)用的專業(yè)領(lǐng)域,包括計算化學、材料化學、工程計算等方面擁有豐富的并行軟件開發(fā)、使用、調(diào)優(yōu)經(jīng)驗。這種技術(shù)專家與應(yīng)用高手相結(jié)合的人員構(gòu)成,使浪潮的HPC解決方案能夠真正深入到行業(yè)應(yīng)用中去,幫助行業(yè)用戶以較低的成本實現(xiàn)高效、可靠的高性能計算。此外,本地化的原廠級服務(wù)也是浪潮的一大特色。原廠工程師、高響應(yīng)級別的技術(shù)服務(wù)支持,能夠保證系統(tǒng)故障在最短時間內(nèi)得到妥善解決,客戶由于技術(shù)故障造成的損失也隨之被降到了最低點。