應(yīng)用復(fù)雜 趕超登月工程
作為國(guó)內(nèi)高性能計(jì)算領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)廠商,在了解到客戶的困惑之后,浪潮立即著手前期調(diào)研和項(xiàng)目規(guī)劃工作。上海生物芯片有限公司目前運(yùn)行的軟件包括生物信息學(xué)相關(guān)軟件、分子動(dòng)力學(xué)相關(guān)軟件、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)相關(guān)軟件等數(shù)十種應(yīng)用??紤]到不同軟件應(yīng)用之間特點(diǎn)千差萬別,需要根據(jù)不同的計(jì)算任務(wù)特點(diǎn)選擇不同的計(jì)算軟件、計(jì)算方法和硬件資源。另一方面,生命科學(xué)平臺(tái)對(duì)于計(jì)算系統(tǒng)性能和存儲(chǔ)系統(tǒng)性能的需求是沒有止境的,如果只是單純的為了搭建此次系統(tǒng)而進(jìn)行設(shè)計(jì),可能會(huì)造成后期升級(jí)乏力,影響平臺(tái)使用壽命,造成資源浪費(fèi)。除此之外,系統(tǒng)功耗也是不得不考慮的因素,因?yàn)樯茖W(xué)平臺(tái)一個(gè)任務(wù)可能需要跑數(shù)天到數(shù)十天,直接帶來電費(fèi)的高投入、機(jī)房空調(diào)的高投入和機(jī)房UPS系統(tǒng)的高投入等等問題。
"兩高一低" 化解應(yīng)用難題
通過與多個(gè)院所生命科學(xué)領(lǐng)域?qū)<业臏贤ㄅc實(shí)際測(cè)試結(jié)果來看,浪潮為上海生物新品公司量身定制了天梭TS10000高性能集群,該集群在設(shè)計(jì)上專注于提高HPC應(yīng)用的運(yùn)行效率,增強(qiáng)系統(tǒng)的可擴(kuò)展性,致力于提升系統(tǒng)的總體計(jì)算能力、加速節(jié)點(diǎn)間的數(shù)據(jù)交換和系統(tǒng)的I/O帶寬。同時(shí),浪潮針對(duì)客戶的實(shí)際運(yùn)算需求,開發(fā)了不同級(jí)別的軟件應(yīng)用,促進(jìn)系統(tǒng)內(nèi)部服務(wù)器、存儲(chǔ)、應(yīng)用之間最大限度趨近協(xié)同運(yùn)算。
在此設(shè)計(jì)原則技術(shù)上,浪潮特別提供了"高性能計(jì)算節(jié)點(diǎn)+高速網(wǎng)絡(luò)+高效能存儲(chǔ)"的整套定制方案。計(jì)算節(jié)點(diǎn)采用的是基于Intel®至強(qiáng)®5500處理器的浪潮NF5220和四路六核服務(wù)器NF520D2。該集群不僅計(jì)算性能高,還具有高擴(kuò)展、低功耗的特點(diǎn),由于采用了智能功耗控制技術(shù),該集群整體功耗比同類產(chǎn)品至少降低10%,在任務(wù)較少時(shí),還可以通過浪潮天梭監(jiān)管軟件遠(yuǎn)程關(guān)閉沒有工作的節(jié)點(diǎn),進(jìn)一步降低開支。
兼顧當(dāng)前 著眼未來
新平臺(tái)上馬之后,許多極具挑戰(zhàn)性的計(jì)算課題,從耗時(shí)幾個(gè)月的"持久戰(zhàn)"變成了幾天之內(nèi)解決戰(zhàn)斗的高效"閃電戰(zhàn)"。作為一個(gè)應(yīng)用型單位,上海生物芯片公司雖然在業(yè)務(wù)領(lǐng)域非常精通,但并不是高性能計(jì)算方面的專家,所以非??释到y(tǒng)廠商能夠基于實(shí)際應(yīng)用,提供精準(zhǔn)的全方位的技術(shù)支持。在這一點(diǎn)上,浪潮的高性能工程師在系統(tǒng)規(guī)劃之初就積極的參與進(jìn)來,并以滿足客戶需求為目標(biāo),真實(shí)有效的解決了實(shí)際問題。天梭TS10000高性能集群解決方案,不但性能卓越,又具備很好的功耗控制和可擴(kuò)展性,充分保護(hù)了客戶的投資,并為未來業(yè)務(wù)拓展預(yù)留了足夠的空間。